В журнале 1 квартиля International Journal of Molecular Sciences (IF 5.6) вышла статья сотрудников лаборатории растительно-микробных взаимодействий Ивана Петрушина (н.с.), Дарьи Гутник (вед. инж.) и Надежды Филиновой (вед. технолог).

Petrushin IS, Filinova NV, Gutnik DI. Potato Microbiome: Relationship with Environmental Factors and Approaches for Microbiome Modulation. International Journal of Molecular Sciences. 2024; 25(2):750. https://doi.org/10.3390/ijms25020750

Коллектив проекта РНФ (https://rscf.ru/project/23-26-10049/) под руководством Иван Петрушина проводит исследование влияния бактериального штамма Rhodococcus qingshengii VKM Ac-2784D на ассоциированные с растением картофеля микроорганизмы. С помощью экспериментов на растениях in vitro планируется выявить антагонизм между R. qingshengii VKM Ac-2784D и микроорганизмами ризо- и эндосферы картофеля классическими микробиологическими методами и при моделировании микробиома. Для изучения состава микробного сообщества проведено метагеномное секвенирование образцов, полученных из ризо- и эндосферы картофеля.

Опубликованный коллективом обзор литературы систематизирует известные сведения о факторах, формирующих микробиом картофеля в различных нишах растения: ризосфере, геокаулосфере и эндосфере. Авторы описывают подходы к модификации микробиома с помощью инокуляции различными бактериальными смесями. В заключении авторы рекомендуют выработать универсальный способ описания исследований микробиома, что позволит проще сравнивать результаты разных исследований между собой и проводить мета-анализ.