В журнале International Journal of Molecular Science (Q1, IF 5,6) вышла статья сотрудников СИФИБР СО РАН с соавторами:

Gorbenko IV, Petrushin IS, Shcherban AB, Orlov YL, Konstantinov YM. Short Interrupted Repeat Cassette (SIRC)—Novel Type of Repetitive DNA Element Found in Arabidopsis thaliana. International Journal of Molecular Sciences. 2023; 24(13):11116.
https://doi.org/10.3390/ijms241311116

Авторы статьи: сотрудники лаборатории генетической инженерии растений вед.инженер Игорь Владимирович Горбенко и зав. лаборатории, д.б.н. проф. Юрий Михайлович Константинов, н.с. лаборатории растительно-микробных взаимодействий, к.т.н. Иван Сергеевич Петрушин, с.н.с. лаборатории молекулярной генетики и цитогенетики растений ИЦИГ СО РАН, д.б.н. Андрей Борисович Щербань и д.б.н., проф. Юрий Львович Орлов (Сеченовский университет).

В работе описаны новые ДНК-элементы SIRC, обнаруженные в ядерном геноме Arabidopsis thaliana, состоящие из прямых повторов, регулярно перемежающихся разнообразной ДНК и организованных в "кассеты". Было проанализировано разнообразие данных элементов, а также ассоциации с известными геномными аннотациями и с эпигенетическими метками хроматина. Авторы предложили гипотезу, что SIRC исходно являлись частным случаем сложной внутренней структуры неавтономных транспозонов MITE, которые впоследствии лишились концевых инвертированных повторов. Обнаруженные элементы присутствуют в самых разных частях генома, включая последовательности индуцибельных генов, что предполагает участие SIRC в регуляции экспрессии. Помимо этого, SIRC могут быть использованы для анализа эволюции MITE, что на сегодняшний день остается сложной задачей, т.к. для обнаружения и классификации MITE используются только последовательности концевых инвертированных повторов.